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光标在‘运行’处停留,对“ 确定 ”键进行按压,进入焦耳模式照射。已经存储好的九个(0-8号)程序号通过按右移键“ ? ”和左移键“? ”来进行选择,已存储的焦耳数值相应的显示于屏幕上。对下移键“? ”和上移键“? ”进行按压,能够对‘ 运行 ’ 或‘ 修改 ’功能进行选择。完成选择以后,光标停留在‘ 运行 ’处,对“确定 ”键进行按压,开始运行程序,点亮紫外灯管,倒记数开始显示于屏幕上,当倒记数变成0的时候,紫外灯管灭了,程序运行结束,实验完成。再对“复位”键进行按压,程序返回到主菜单。

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当在电场当中放置一种分子的时候,它们就会以一定的速度向适当的电极移动。在电场作用下这种电泳分子下的迁移速度,称为电泳的迁移率。电场的强度正相关于电泳分子本身所携带的净电荷数。也就是说,越大的电场强度,电泳分子携带越多的净电荷数量,也就获得的越快的移动速度,相反就比较的慢,因为一种无反应活性的稳定的支撑介质在电泳中被使用,从而使得对流运动被降低了,因此电泳的迁移率负相关于同分子的摩擦系数。分子的大小、极性及介质粘度的函数为已知的摩擦系数。所以蛋白质或核酸分子混合物中的各种成分能够以分子大小的不同、构成或形状的差异,以及所带的净电荷的多少为依据使用电泳来将它们彼此分离开来。在生理条件下,核酸分子的糖-磷酸骨架中的磷酸基团呈离子状态,从这种意义上讲,DNA和RNA多核苷酸链可称为多聚阴离子。所以当在电场中放入核酸分子,它们就会往正电极的方向迁移。因为糖-磷酸骨架结构上的重复性质,数量相同的双链DNA所具有的净电荷几乎是等量的,所以它们往正电极的方向迁移的速度几乎是相等的。在一定的电场强度下,核酸分子本身的大小和构型决定了电泳的迁移率,亦即DNA分子的这种迁移速度,分子量较大的DNA分子迁移速度要慢于分子量较小的DNA分子。这就是应用凝胶电泳技术分离DNA片段的基本原理。

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